地質與生物
馬祖列島位於閩江口東方約15公里,是大陸棚上的火山碎屑岩,其岩齡約在 9千萬至1億年(張長義,1998;陳培源,1974)。馬祖各島的岩石皆屬火成岩及其變質岩,以花崗岩與花崗閃長岩為主體,兼有少數之侵入岩體與酸性火山岩,現代沉積岩只見於狹小溪谷與海灘。由於花崗岩質地較結實堅硬不容易風化,即使表層的岩石,也需要經過相當長的時問才能風化成為土壤,部分地區甚至沒有完整的土壤化育(張長義,1998;陳培l974),例如南引島;然而馬祖在東北和西南季風及雨水、海浪侵蝕下,使得島上的機械風化較為旺盛,加上氣候等因子,使得馬祖大部分地區仍有土壤發育,但皆為較薄的土壤層,而這樣的土壤層也會影響馬整個植被及植物的生長狀況。
在1億年前,印度板塊由南向北漂移,最後與歐亞板塊相銜接,並擠入歐亞板塊之下,於6千5百萬年前至2百萬年前,兩個板塊交會之處不斷往上抬昇,最後形成喜馬拉雅山系。之後2百萬年來的第四紀冰期,中國大陸南方成為世界最多古老植物孕育的地方之一,但由於喜馬拉雅山高聳的山脈,阻斷來自印度洋的西南氣流,當地偏好海洋性氣候環境的植物就逐漸由喜馬拉雅山一帶,往中國大陸華南地區及臺灣遷移。在地理位置上,馬祖恰好處於華南與臺灣之間,所以馬祖的植物相,實是兼具中國大陸與臺灣低海拔植物的特色,而與喜馬拉雅山是相關的。在生物地理上,冰河期與間冰期的消長可造成海平面的上升與下降,使大陸與島嶼或島嶼與島嶼間形成分離或相連的現象,進而影響生物的分佈、遷徙與演化。在最冷的冰期,當時的海平面比現今約低了100m(王荷生,1992)。馬祖列島、大陸、臺灣之間便有機會相連在一起,植物也在三地之間進行遷徙、交流。在最後一次冰期結束之後,馬祖和大陸沿海其他島嶼一樣,從大陸棚平原上的小山丘變成海島,各島嶼從此彼此隔離。馬祖地區與大陸、臺灣雖然具有類似的植物組成,但數十萬年來長期分隔,在各島間形成了不同的生態特色。